一天，宇宙開發中心的上空發現了來歷不明的太空船，一名神秘女子出現，中心繼而受到兩隻怪獸的襲擊。超人高斯及時出現，但怪獸極之頑強，高斯幾乎不敵，幸得春野武藏之助，二人融為一體後始威力大增，而正當怪獸快被擊退之際，另一個超人迪斯忽然出現，她竟然出手阻止高斯保護地球，最後竟令高斯及武藏死於怪獸之手。太空船的目的到底是什麼？原來，神秘女子來地球竟是為了維持宇宙的秩序，而要把地球上所有生物全部消滅！為了自救，地球各國各盡辦法，但似乎，高斯的死已是提前判了死刑。地球即將毀於一旦，大家了無辦法，除非奇蹟出現然而，武藏的親人和隊友都堅信高斯和武藏未死，他們四出奔走，希望奇蹟真的出現！按照现在通行的惯例，这部应该译作《高斯大战杰斯提斯之最终决战》，这个“最终决战”（TheFinalBattle）与“最终圣战”（TheFinalOdyssey）有什么区别我不是很清楚。故事起因跟盖亚TV有些相似，宇宙判官德拉西翁基于某个可能出现的未来在那个未来强大起来的人类逐渐暴露出残忍嗜杀的天性进而威胁到整个宇宙的和平稳定得出了“应趁事态恶化前将人类消灭在当前的萌芽中”这个结论。督促执行这个清除命令的杰斯提斯同意德拉西翁的结论，但两者的理解并不完全相同，和德拉西翁恐惧人类强大恰恰相反，杰斯提斯藐视人类的弱小，在Ta（女性人间体却在巨人形态下发出雄浑有力的吼声，阴阳人？）看来这样卑微的物种理应被宇宙主动淘汰，不配享有未来和发展的权利。而宇宙中不同物种间相互理解、平等对话、和谐共处则一直是高斯的梦想。高斯（Cosmos）意为“秩序”，杰斯提斯（Justice）意为“正义”，如果这两个词没有什么歧义的话，或许对调一下更符合两人的立场路线。开场没几分钟高斯就领了便当，使得杰斯提斯看起来更像是主角。当然这一切都是高斯的阴谋，他想让杰斯提斯深入人民群众，亲身体验人间百态、社会冷暖，从而改变杰斯提